方濱興院士為國內網絡與資訊安全領域資深權威學者，長期深耕網絡安全與資訊安全理論與關鍵技術研究，研究體系完備、覆蓋領域廣泛。其主要研究方向包含資訊安全體系架構、網絡協議分析技術、IPv6網絡技術、網絡應急響應與處置技術、系統災難備援技術、網絡入侵檢測技術、蜜網技術、電腦病毒防禦技術、資訊擷取與智能分析技術、高效文字匹配演算法、網絡穩健性優化、網格運算及其安全防護技術等多個前沿領域，全方位助力我國網絡資訊安全體系的技術建設與升級。

在科研深耕與技術攻關方面，方濱興院士早在1989年便率先開展電腦病毒防禦技術的前瞻性研究，並於1992年出版《電腦病毒及其防範》專著，為國內早期電腦安全防護領域搭建了重要的理論與實踐參考體系。1990年代後期，其研究重心進一步拓展至網絡安全入侵檢測領域，持續填補國內相關技術研究空白。1999年，方濱興院士率先提出構建國家資訊安全基礎設施的重要理念，並牽頭組織搭建相關核心系統，為我國國家層面資訊安全防禦體系建設筑牢技術根基，具備深遠的行業影響與戰略意義。

在學術成果沉澱方面，方濱興院士長期堅持理論研究與學術創新，科研著述成果豐碩。截至2017年3月，其已於海內外重點核心學術期刊、頂級學術會議累計發表學術論文400餘篇，出版學術專著3部，以紮實的學術積澱推動網絡資訊安全領域的理論迭代與技術創新，為行業人才培養與學科發展提供了重要的學術支撐。